Onddoen infekzioak gorputzean naturalki dauden mikroorganismoen desoreka sinple batetik sortzen dira askotan.

Hain zuzen ere, onddo eta bakterio ugarik kolonizatzen dute, gehienetan kaltegabeak eta baita funtsezkoak gorputzaren funtzionamendu egokirako ere.

Hala ere, gerta daiteke onddo horietako batzuk ugaritzea eta patogeno bihurtzea, edo "kanpoko" onddo batek, animalia batek kutsatutakoak adibidez, infekzioa sortzea. 200-400 onddoak Guztira, gizakiak gaixotasuna eragin dezake⁵.

Hala ere, onddoak dauden ingurunean, halaber kutsatu gizakiak, adibidez:

• txertaketaren bidez, lesio batean adibidez (esporotrikosia edo kromomicosia sorrarazten duena, etab.);
• moldeak (histoplasmosis, apergillosis, eta abar) arnastea bidez;
• kutsatutako pertsona bat (candidiasis, ringworms, eta abar) kontaktua eginez;
• kutsatutako animalia batekin kontaktuaren bidez.